حضرت آیت‌الله سبحانی طی سخنانی در کنگره بزرگداشت میرزای نائینی که در سالن همایش های مدرسه علمیه امام کاظم علیه السلام برگزار شد، با تأکید بر جایگاه علمی و اخلاقی این عالم برجسته و مرور تاریخ هزار ساله حوزه نجف، نقش مرحوم نائینی را در تداوم مجاهدت علمی و فرهنگی حوزه‌های علمیه بسیار مهم دانسته و گفتند: این گردهمایی بزرگ با هدف تکریم عالم بزرگی برگزار شده است که خدمات ارزنده‌ای به جامعه اسلامی و شیعی ارائه کرده و از درخت پربار نجف اشرف برخاسته است. این مراسم مقارن با مرور هزار سال از تأسیس حوزه علمی نجف است که در سال ۱۴۷ هجری قمری تشکیل شد و امروز، هزار سال از تأسیس آن می‌گذرد.